Sesuatu yang misteri sering kali terjalin dalam penerbangan Apollo. Apollo 12 ditemani oleh dua UFO bercahaya semasa tiga orbitnya mengelilingi bulan. Misi Apollo 13 sama sekali tidak berjaya. Pada bulan, cahaya misteri mula menghantui dirinya. Pada 13 April 1970, sebuah tangki oksigen tiba-tiba meletup di atas kapal, dan angkasawan terpaksa meninggalkan pendaratan bulan di kawah Fra Mauro.
Terdapat versi bahawa tangki oksigen diletupkan oleh UFO, mencegah orang Amerika membawa bom atom ke bulan untuk penyelidikan seismik. Akibat kemalangan ini, angkasawan hanya dengan susah payah berjaya memasuki orbit bumi rendah dan kembali ke planet asal mereka. Misi Apollo 15 menyaksikan UFO besar terbang perlahan di permukaan bulan. Akhirnya, komandan Apollo 16 John Young menemui prisma kaca yang rapi di dalam debu bulan, yang dianggarkan berusia berbilion tahun.
Pada tahun 1996, sebuah buku oleh Dr Edwin Rais, salah seorang pengarang projek Apollo 17, yang berjudul "Lost Space" diterbitkan di Amerika Syarikat. Rais mendakwa bahawa dalam ekspedisi ini para angkasawan menemui penduduk bulan tertentu. Semasa melakukan perjalanan di permukaan satelit planet kita di Rover, mereka diduga menemui sebuah struktur berkubah kecil, kira-kira tiga ela, dari mana kira-kira selusin makhluk aneh tiba-tiba keluar. Mereka tidak berusaha menyerang kenderaan itu, tetapi tiba-tiba berhenti mematuhi angkasawan. Pada masa yang sama, ucapan jelas dan nyaring terdengar di fon kepala mereka, yang disampaikan ke Houston, di mana ia segera diterjemahkan dari bahasa Latin.
Ternyata makhluk-makhluk itu memberitahu para angkasawan bahawa mereka telah menyerang wilayah asing, dan bahawa mereka harus pulang. Sebaik sahaja semua orang dan semua memahami, kawalan ke atas Rover dipulihkan, dan penduduk bumi bergegas ke kenderaan keturunan bulan mereka.
