Para saintis dari Baylor College of Medicine di Amerika Syarikat telah menunjukkan bahawa pengambilan kopi yang kerap menyebabkan penurunan risiko terkena penyakit kardiovaskular, diabetes dan disfungsi hati. Ringkasan penyelidikan boleh didapati di laman web American College of Gastroenterology.
Kajian ini melibatkan 34 orang yang menjalani pemeriksaan kolonoskopi dan tidak mengalami perubahan patologi pada usus besar. Sukarelawan melengkapkan soal selidik yang menunjukkan kekerapan pengambilan kopi. Para pakar mengambil 97 sampel selaput lendir dari pelbagai bahagian usus pesakit dan mengasingkan DNA mikroorganisma yang membentuk mikroflora. Kemudian DNA yang mengekod RNA ribosom 16S diperluas semasa proses penguatan, iaitu salinan tambahan gen yang diasingkan dibuat, yang memudahkan pengenalannya.
Para saintis telah menetapkan urutan nukleotida DNA, menentukan kepunyaan mereka dari kumpulan bakteria yang berlainan. Mereka kemudian membandingkan kepelbagaian mikroba dan frekuensi taksa yang tinggi (lebih besar daripada 82.9 miligram sehari) dan pengambilan kafein rendah (kurang daripada 82.9 miligram).
Ternyata mereka yang minum banyak kopi mempunyai kepelbagaian alpha yang lebih tinggi, iaitu kepelbagaian dalam komuniti mikroba, berbanding yang lain. Juga, kumpulan mikroorganisma dalam peminum kopi sangat berbeza dengan kumpulan yang tinggal di usus peserta yang minum sedikit kafein. Bilangan Faecalibacterium dan Roseburia, yang mempunyai kesan anti-radang, meningkat, dan Erysipelatoclostridium dan Lachnospiraceae yang berpotensi berbahaya menurun. Hubungan ini diperhatikan tanpa mengira usia dan kualiti pemakanan.
16S ribosom RNA (16S rRNA) adalah salah satu komponen utama ribosom (mensintesis protein organel sel) dalam bakteria dan archaea. Gen yang mengekodkan 16S rRNA digunakan dalam filogenetik untuk menentukan hubungan evolusi antara kumpulan mikroorganisma yang berlainan kerana kadar evolusi kawasan DNA ini yang rendah. Pada masa ini, pangkalan data sedang dibuat yang mengandungi maklumat mengenai mikroba yang mengandungi satu atau varian gen 16S rRNA yang lain.
