Bakteriofag tanpa DNA yang tidak dapat dikesan tidak dapat dikesan dengan kaedah standard - tetapi sekarang para saintis percaya bahawa mereka menguasai lautan dunia.
Setiap titisan air yang tidak terlalu dalam dari permukaan laut mengandungi sekitar 10 juta virus. Tidak menghairankan bahawa ahli biologi sentiasa menemui yang baru, walaupun penemuan kumpulan baru masih jarang berlaku. Nampaknya teknik standard tidak memungkinkan mereka untuk diperhatikan, walaupun virus seperti itu ternyata sangat banyak - mungkin ia tersebar tidak hanya di lautan dan hanya para saintis yang terhindar.
Martin Polz dari Institut Teknologi Massachusetts dan rakan-rakannya memeriksa sampel air yang diambil di pantai Amerika Utara di Lautan Atlantik. Mereka mencari virus yang mengandungi DNA untai ganda - virus seperti itu sangat meluas, termasuk herpes, dan bakteriofag T4 (Caudovirales) yang tidak asing lagi bagi semua orang dari sekolah. Setelah menjangkiti kultur bakteria laut Vibrionaceae, para saintis menemui 200 virus DNA yang berbeza, 18 di antaranya disebabkan oleh Autolykiviridae yang baru. Mereka menulis tentang ini dalam artikel yang diterbitkan dalam jurnal Nature.
Nama kumpulan itu merujuk kepada pahlawan mitologi Yunani Autolycus, pencuri licik yang sukar ditangkap seperti virus ini. "Virus yang paling umum di Bumi adalah virus yang menjangkiti bakteria yang mengandungi DNA untai ganda," tulis Poltz dan rakan-rakannya. "Namun, Caudovirales dengan virus ekor, yang mendominasi pangkalan data dan koleksi tanaman, tidak mewakili keberadaan mereka di lingkungan. Sebenarnya, virus tanpa virus menguasai sampel air."
Sel Bakteria yang Dijangkiti dengan Autolykiviridae / MIT Phages, Kauffman et al., 2018.
Bakteriofag "Tailless" Autolykiviridae dibezakan dengan ukuran genom kecil - hanya kira-kira 10 ribu pangkalan, 4-5 kali kurang daripada saudara-mara "berekor". Keupayaan mereka untuk menjangkiti dan membunuh sel bakteria juga tidak biasa. Sekiranya fasa biasa dalam eksperimen, sebagai peraturan, mempengaruhi satu spesies vibrio tertentu, ini secara purata menjangkiti empat dan menyebabkan kematian sel yang lebih tinggi. "Mereka didapati bertanggung jawab atas 40 peratus kematian akibat bakteria, walaupun mereka menyumbang sekitar 10 persen dari jumlah virus dalam sampel," jelas salah seorang penulis karya tersebut.
Bakteria Vibrio dari pelbagai spesies terletak di sepanjang perimeter rajah; lingkaran virus yang menjangkiti mereka dikaitkan dengan mereka: bakteriofag biru - "berekor", oren - "tailless" Autolykiviridae / MIT, Kauffman et al., 2018.
Angka-angka ini menunjukkan peranan besar yang dimainkan oleh kumpulan baru Autolykiviridae dalam pengaturan populasi bakteria dan di biosfer secara keseluruhan. Para saintis yakin bahawa teknik mereka akan membantu mencari virus yang sebelumnya tidak dapat dikesan di dalam tanah, dan mungkin di usus manusia. Urutan genetik yang serupa memang terdapat pada genom bakteria dalam mikroflora manusia.
Video promosi:
Sergey Vasiliev
